• 初始化:

  units（设置单位）

  dimension（设置模拟体系的维度） ，boundary（边界条件）, atom_style（设置体系原子固有的属性）

• 定义计算体系:

  lattice,

  **region（定义特定的几何区域）,**

  create_box, create_atoms, read_data, read_restar

• 设置计算参数

  • 力场设定：pair_style, pair_coeff(pairwise potential)

  • 模拟参数：neighbor, neigh_modify, group, timestep, min_style

  • 边界条件，积分等：

    fix（对原子定义的一种操作）

  • 计算相关：

    compute 计算

    compute_modify,variable

  • 输出控制：thermo, dump,restart

• 启动模拟minimize, run

command by category

settings

operations within timestepping

• unit 设置所使用的单位制。 style = ljor real or metal or sior cgs or electron默认单位制为lj

• boundary 设置模拟盒子的边界条件。x, y, z = p or s or f or m, one or two letters

   p（period）周期性边界条件。 当原子从盒子的一边跑出时，从相反的另一边进入盒子。
  

  f（non-period and fixed）非周期性固定边界条件。

examples - Cu

graph LR;
公司架构-->商务
公司架构-->研发
公司架构-->设计
公司架构-->运营
公司架构-->产品